Według informacji podanych przez Instytut Marynarki Wojennej Stanów Zjednoczonych niedawno odkryte pozostałości zlokalizowane na głębokości ponad 6 217 metrów, na wodach Morza Filipińskiego, mogą być szczątkami USS Johnston.
Wrak został znaleziony przez zespół naukowców z Vulcan Inc, firmy założonej przez zmarłego filantropa Paula Allena. Zdaniem Roba Krafta, dyrektora operacji podwodnych „Ten wrak jest całkowicie zdziesiątkowany”, „To tylko gruz. Nie ma struktury kadłuba. ” Niszczyciel klasy Fletcher, o numerze kadłuba DD-557, zatonął podczas bitwy o Samar 25 października 1944 r., w trakcie inwazji na wyspę Leyt. Materiał pokazujący pozostałości szczątków został opublikowane na stronie Petrel w środę na Facebooku Znalezione pozostałości, według Roberta Neylanda z Departamentu Dowodzenia Podwodnej Archeologii Historii i Dziedzictwa Morskiego muszą zostać zidentyfikowane na podstawie części kadłuba z numerem, nazwą okrętu, lub osobistymi przedmiotami załogi. Pozwoli to wykluczyć szczątki innego okrętu klasy Fletcher — USS Hoel (DD-533), który również znajdował się w okolicy w czasie bitwy.